Ты предлагаешь: говорить сразу "нет", задумается - хорошо, не задумается - его трудности.
Я предлагаю: сначала человеческое отношение, предоставление шанса понять, может даже в чем-то помочь человеку, задумается парень - хорошо, а нет - его трудности.
При обоих стратегиях всегда будет кто-то, кто задумается, и кто-то, кому такое отношение к нему девушки навредит. Жесткий отказ может изменить человека в лучшую сторону, а может сделать психом. Человеческое отношение может пойти на пользу, поддержать человека, а может, как в приведенном тобою примере - навредить, потому что парень это человеческое отношение может неправильно истолковать. (Хотя, по правде, твой пример мне вообще не ясен. Она объясняла тебе, что не хочет с тобой близких отношений, объясняла почему? Если она относилась к тебе как к другу, но ни разу не села наедине и не проговорила: "Я не хочу с тобой близких отношений по тому-то и тому-то", то значит она тебе вообще не отказывала, мы же здесь говорим про способы человечного, но - отказа. Или отказывала, но информацию до тебя донести не смогла. Значит, понимания между вами было недостаточно. Тут нужно знать развитие ситуации в деталях, но в любом случае причиной нежелательных последствий было недопонимание, а не ее добрые к тебе чувства).
Есть люди, которые понимают только язык силы, только жесткий отказ. Но есть и чувствительные, еще не очень уверенные в себе, легко ранимые натуры, но вместе с тем - способные девушку понять. Вот ради этих последних и стоит хотя бы пытаться относиться к другим людям по-человечески.
Еще раз повторюсь: если человеческое отношение "не катит", если человек явно не понимает, тогда можно и даже нужно расставаться жестко;
но ни в коем случае нельзя сходу посылать без объяснений, не разобравшись, кто перед тобой, и чем твой отказ в такой форме ему может грозить.Люди разные бывают. Ориентироваться надо на умных и добрых
И изначально исходить из того, что перед тобой - как раз такой человек, или, по крайней мере, способный таким стать.
Делай, что можешь, и будь, что будет.